Este regime fiscal é obrigatório para as empresas constituídas em sociedade, como por exemplo as sociedades anónimas, sociedades por quotas e as sociedades em nome individual.

Os sujeitos passivos que sejam profissionais liberais e empresários em nome individual que tenham um montante anual ilíquido de rendimentos superior a 200.000,00€ (150.000,00€ até 2014) encontram-se igualmente abrigados pelo regime de contabilidade organizada.

• A contabilidade organizada é o regime fiscal mais eficiente para atividades de maior complexidade e quando as despesas com a atividade são superiores a 25% dos rendimentos. (o regime simplificado considera, como regra geral, que 25% do rendimento é encargo, tributando 75% do rendimento)
• Ao contratar um contabilista certificado, liberta-se das burocracias e garante que está a pagar os impostos adequados ao seu negocio. Um profissional externo vai lhe dar um maior apoio na gestão do seu negócio.
• Permite utilizar beneficios fiscais, apoios e incentivos para reduzir os impostos a pagar.

Na contabilidade organizada podem ser deduzidas as seguintes despesas inerentes ao exercício da atividade:

• Utilização de viatura própria;
• Gastos com combustíveis, deslocações e estadias;
• Depreciações e amortizações de materiais informáticos, como por exemplo computadores e impressoras;
• Residência da atividade;
• Empréstimos bancários;
• Multas e coimas pela prática de infrações;
• Contabilista Certificado.

A mudança entre regimes fiscais é possível, mas deve ser cuidadosamente planeada. Se o volume de negócios da sua empresa aumentar e ultrapassar os 200.000 euros anuais, será automaticamente obrigado a optar pela Contabilidade Organizada no ano seguinte. No entanto, caso esteja no Regime Simplificado e deseje mudar para a Contabilidade Organizada antes de atingir este limite, pode fazê-lo, devendo comunicar a sua decisão às autoridades fiscais até ao final do mês de março do ano seguinte ao da opção.